◎教育目標：

     本系著重培養食品工業技術人才，期能擔負食品之加工、製造、分析、檢驗、管理和生產等任務。

　　(一)針對金門農業特產，培育農產品加工，生產之人才。

　　(二)配合地區特色，培養酒類釀造，生產和分析之人才。

　　(三)配合國家發展計劃，培養酵素在食品上應用，酵素生產和以生物科技生產酵素之基礎技術人才。

 ◎教學特色：

   本系教學兼顧實務與理論，研究以金門地區傳統食品加工和全國性之食品業並重，且尋求貫穿傳統與將來食品工業。課程規劃著重於食品加工、食品化學、食品微生物和食品生物技術等為四大主軸，使學生在傳統加工之外，並能銜接最近之生物技術重點科技。

    配合食品產業的發展，因應現代人對保健營養、食品衛生安全與生物技術之訴求，以培養食品工業技術人才，期能擔負食品之加工製造、生產技術、衛生管理人才、品管檢驗分析、經營管理及科技法律與智慧財產領域等任務。